Современное экранное воплощение идеи майи — иллюзорности материальной жизни и явления в мир Мессии. Теперь в роли спасителя выступает рядовой программист Томас Андерсон, который по ночам противостоит системе, становясь хакером Нео. Не обошлось без предтечи — Морфеуса и Троицы — Тринити. Они выдёргивают героя из иллюзорной жизни, в которой он вполне комфортно устроился, и вовлекают в водоворот опасных приключений, цель которых — спасение человечества от бессознательного рабского существования в качестве батареек для победившей цивилизации машин. Нео предстоит нелёгкое испытание собственных нравственных устоев и смертельная битва с системой, поработившей людей. Кто он — долгожданный Избранный или сбой программы?
Итоговая часть футуристической трилогии «Матрица», продолжение второй части кинофильма, закончившегося сумбурно. Представлен результат долгосрочного сражения человечества за свободу. Армия Машин намеревается уничтожить Зион, жители обороняются, как могут. Можно ли препятствовать бесповоротному захвату города до момента, когда Нео найдёт подмогу? Нео отправляется к Источнику на встречу с Главным Компьютером, предлагает сделку: при победе над Смитом, заполнившим Матрицу, машины перестанут воевать с человечеством. Главный Компьютер идёт на уступки. Людей ждёт заключительная битва.
После событий первой части фантастического фильма прошло всего полгода. Миром правят машины, которые захватили людей и поместили их в специальные капсулы. Те проживают в искусственно созданной реальности и думают, что счастливы. Но на планете все же остались по-настоящему свободные люди, которые пытаются побороть машины. После того, как к ним присоединяется Нео, у людей появляется реальный шанс победить роботов, ведь среди них есть избранный, действительно понимающий, что происходит. Борцы за свободу Нео, Тринити и Морфеус берут на себя руководство армией людей против жестоких машин. Чтобы прекратить вечные репрессии и эксплуатацию человеческого разума, им придется не только использовать продвинутое оружие, но и раскрыть свои лучшие навыки.