Два года спустя после победы над десептиконами Сэм Уитвики пытается начать обычную жизнь в колледже. Но таинственные символы в его сознании вновь делают его мишенью — и всю планету ставят на грань катастрофы.
Учёный и полковник через древний портал попадают в мир, где люди поклоняются богу Ра. Чтобы вернуться, им придётся разгадать внеземные тайны и бросить вызов жестокому псевдобожеству.