14-летний Дэнни обретает призрачные силы после аварии в лаборатории родителей. Теперь он балансирует между школой и тайной миссией по защите города от выходцев из Зоны Призраков, скрывая двойную жизнь даже от семьи.
Шреддер создаёт смертоносных мутантов и робота, но планам злодея мешает загадочный инопланетянин Кэм. Героям предстоит спасти Нью-Йорк и целый мир черепах на краю галактики!