1963 год, Иокогама. Школьница Уми ежедневно поднимает сигнальные флаги в память об отце-моряке. Её жизнь меняется, когда она бросает вызов планам сноса исторического здания школьных клубов, объединив силы с харизматичным редактором газеты.
Странствующий эксперт Гинко исследует загадочных существ «муси» — невидимых простым людям духов, вызывающих мистические явления. Его путешествие сквозь живописные пейзажи Японии раскрывает тайны, где наука переплетается с легендами .